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丙烯酰胺凝胶电泳

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发表于 2005-5-11 19:02:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
  聚丙烯酰胺凝胶电泳是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的电泳方法。在这种支持
介质上可根据被分离物质分子大小和分子电荷多少来分离。
聚丙烯酰胺凝胶有以下优点:
①聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺和N,N'甲叉双丙烯酰胺聚合而成的大分子。凝胶有
格子是带有酰胺侧链的?碳-碳聚合物,没有或很少带有离子的侧基,因而电渗作用
比较小,不易和样品相互作用。
②由于聚丙烯酰胺凝胶是一种人工合成的物质,在聚合前可调节单体的浓度比,形成
不同程度交链结构,其空隙度可在一个较广的范围内变化,可以根据要分离物质分子
的大小,选择合适的凝胶成分,使之既有适宜的空隙度,又有比较好的机械性质。一
般说来,含丙烯酰胺7-7.5%的凝胶,机械性能适用于分离分子量范围不1万至100万物
质,1万以下的蛋白质则采用含丙烯酰胺15-30%的凝胶,而分子量特别大的可采用含
丙烯酰胺4%的凝胶,大孔胶易碎,小孔胶则难从管中取出,因此当丙烯酰胺的浓度增
加时可以减少双含丙烯酰胺,以改进凝胶的机械性能。
③在一定浓度范围聚丙烯酰胺对热稳定。凝胶无色透明,易观察,可用检测仪直接测
定。
④丙烯酰胺是比较纯的化合物,可以精制,减少污染。
合成聚丙烯酰胺凝胶的原料是丙烯酰胺和甲撑双丙烯酰胺。丙烯酰胺称单体,甲撑双
丙烯酰胺称交联剂,在水溶液中,单体和交联剂通过自由基引发的聚合反应形成凝
胶。
  在聚丙烯酰胺凝胶形成的反应过程中,需要有催化剂参加,催化剂包括引发剂和
另速剂两部分。引发剂在凝胶形成中提供始自由基,通过自由基的传递,使丙烯酰胺
成为自由基,发动聚合反应,加速剂则可加快引发剂放自由基的速度。常用的引发剂
和加速剂的配伍如下表:


聚合反应催化剂配伍

引 发 剂
加 速 剂

(NH4)2S2O8
TEMED

(NH4)2S2O8
DMAPN

核 黄 素
TEMED


注:(NH4)2S2O8,过硫酸胺
TEMED:N,N,N,N'?FONT FACE=\"宋体\" LANG=\"ZH-CN\">四甲基乙二胺
DMAPN:β-二甲基胺基丙晴
  用过硫酸铵引发的反应称化学聚合反应;用核黄素引发,需要强光照射反应液,
称光聚合反应。
聚丙烯酰胺聚合反应可受下列因素影响:
1、大气中氧能淬灭自由基,使聚合反应终止,所以在聚合过程中要使反应液与空气
隔绝。
2、某些材料如有机玻璃,能抑制聚合反应。
3、某些化学药物可以减慢反应速度,如赤血盐。
4、温度高聚合快,温度低聚合慢。
以上几点在制备凝胶时必须加以注意。
凝胶的筛孔,机械强度及透明度等很大程度上由凝胶的浓度和交联决定。每100亳升
凝胶溶液中含有单体和交联剂的总克数称凝胶浓度,常用T%表达;凝胶溶液中交联剂
占单体和交联体总量的百分数称为交联度,常用C%表示,可用下式计算:


 

 

 

公 式

a:丙烯酰胺克数; b:甲撑双丙烯酰胺克数;m:缓冲液体积(毫升)
凝胶浓度过高时,凝胶硬而脆,容易破碎;凝胶浓度太低时,凝胶稀软,不易操作。

交联度过高,胶不透明并缺乏弹性;交联度过低,凝胶呈糊状。
聚丙烯酰胺凝胶具有较高的粘度,它不防止对流减低扩散的能力,而且因为它具有三
度空间网状结构,某分子通过这种网孔的能力将取决于凝胶孔隙和分离物质颗粒的大
小和形状,这是凝胶的分子筛作用。由于这种分子筛作用,这里的凝胶并不仅是单纯
的支持物,因此,在电泳过程中除了注意电泳的基本原理以外,还必须注意与凝胶本
身有关的各种性质(网孔的大小和形状等)。可通过下式计算来选择适当的凝胶网
孔。

公 式


式中:P为网孔平均直径,C为多聚体浓度,d为该多聚体分子直径(若不是卷曲的分
子应为5A),K为常数,K值取决于涨胶的几何构型,假如多聚体的链是以近似于直角
交联的,则约为1.5根据此式,我们可以通过多聚体浓度C近似地计算出网孔直径,例
如已知多聚体浓度为5%,其网孔平均直径应为:


 

 

 

公 式

这样的计算是粗略的,与实际情况有一定距离,有人测定了总浓度(T)为6.5?FONT
FACE=\"宋体\" LANG=\"ZH-CN\">20%的丙烯酰胺液,在六种不同比例的双丙烯酰胺存在
下,聚合后的网孔大小,发现孔径与总浓度有关,总浓度愈大,孔径相应变小,机械
强度增强,与总浓度不变时,甲叉双丙烯酰胺(Bis)的浓度在5%时孔径最小,高于或
低于此值时,聚合体孔径都相对变大,凝胶孔径在凝胶电泳中是一个重要的参数,它
往往决定了电泳的分离效果。经过不断的实践,得到了如表3?FONT FACE=\"宋体\"
LANG=\"ZH-CN\">3所示的经验值,在一般情况下,大多数生物体内的蛋白质采用7.5%浓
度的凝胶,所得电泳结果往往是满意的,因此称由此浓度组成的凝胶为“标准凝
胶”。


对那些用于重要研究的凝胶,最好是通过采用4?FONT FACE=\"宋体\" LANG=\"ZH-CN\">
10%的一系列凝胶浓度梯进行预先试验,以选出最适凝胶浓度。


 

表3?FONT FACE=\"宋体\" LANG=\"ZH-CN\">3 不同分子量范围的蛋白质和核酸在凝胶电泳
中所选用的凝胶浓度百分率


物 质
分子量范围
适用的凝胶浓度(%)

蛋白质
<10
1-4×104 
4×10-1×105
1-5×105
>5×105
20-30 15-20 10-15 5-10 2-5

核酸
<104
104-105
105-2×106
10-20
5-10
2-3.6


聚丙烯酰胺凝胶电泳可分为连续的和不连续的两类,前者指整个电泳系统中所用缓冲
液,pH值和凝胶网孔都是相同的,后者是指在电泳系统中采用了两种或两种以上的缓
冲液,pH值和孔径,不连续电泳能使稀的样品在电泳过程中浓缩成层,从而提高分辨
能力。


蛋白质在聚丙烯酰胺凝胶中电泳时,它的迁移率取决于它所带净电荷以及分子的大小
和形状等因素。如果加入一种试剂使电荷因素消除,那电泳迁移率就取决于分子的大
小,就可以用电泳技术测定蛋白质的分子量。1967年,Shapiro等发现阴离子去污剂
十二烷基硫酸钠(SDS)具有这种作用。当向蛋白质溶液中加入足够量SDS和巯基乙
醇,SDS可使蛋白质分子中的二硫键还原。由于十二烷基硫酸根带负电,使各种蛋白
质—SDS复合物都带上相同密度的负电荷,它的量大大超过了蛋白质分子原的电荷量,
因而掩盖了不同种蛋白质间原有的电荷差别,SDS与蛋白质结合后,还可引起构象改
变,蛋白质—SDS复合物形成近似“雪茄烟”形的长椭圆棒,不同蛋白质的SDS复合物
的短轴长度都不一样,约为18A,这样的蛋白质—SDS复合物,在凝胶中的迁移率,不
再受蛋白质原的电荷和形状的影响,而取决于分子量的大小,因而SDS?FONT FACE=\"宋
体\" LANG=\"ZH-CN\">聚丙烯酰胺凝胶电泳可以用于测定蛋白质的分子量。
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