为了便利检索利用这部大书,历来也有一些有心人士编纂目录索引。举要如下:
(一) 总目四十卷:冠于书首。
(二) 俞昭编图书集成编目。
(三) 日本文部省,古今图书集成目录。明治45年刊行。
(四) Lionel Giles,An Alphabetical Index to the Chinese Encyclopeadia Chi’n Ting Ku Chin Tu Shu Chi Cheng. 1911年大英博物院出版。
(五) (日)泷泽俊亮编,图书集成分类索引。大连市:右文阁,民国22年。
(六) 香港牟润孙等编,古今图书集成中明人传记索引。香港:明代传记编纂委员会,民国52年。
(七) 台北文星书店编,古今图书集成索引。台北市:文星书店,民国53年。
(八) (日)枑尾武编集,古今图书集成引用书目稿(历象汇编干象典)。 京:樱美林大学文学部中国文学研究室,民国61年至66年,3册。
(九) 杨家骆主编、孙先助总整理,古今图书集成各部列传综合索引。台北市:鼎文,民77年。
以上的目录与索引是查找这一部大书的主要工具。其中,文星版的索引比较详细。内容包括:(1)册号总表,(2)汇编、典、部,卷中英对照表,(3)典、部总表,(4)中文分类索引部首检目表,(5)中文分类索引、(6)地方行政区划统计表(职方典),(7)古今地名对照索引,(8)今古地名对照索引,(9)考证索引,(10)考证勘误表,(11)英文索引。