评估混合人群祖先基因的新方法

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最近的基因分型技术给理解复杂疾病等相关问题带来了空前的机遇。进行这项研究的最大障碍是潜在的亚群之间能产生假象联系。之前的研究大都采用基因分型、平行比较对照和病例组的基因频率等方法。这种方法很难观察到人群原始的基因结构。

加州大学和卡耐基-梅隆大学的科学家们开发出了一个新的研究混合人群中当地祖先（LAMP）的方法。这个方法推断出个体在每个单核苷酸多肽位点的祖先。LAMP通过计算SNPs邻近的重叠区域并结合大多数公认的结果来确定人群的亚结构。LAMP可用于估计个体的基因混合程度。实践证明，这项技术在评估混合人群的祖先基因中比STRUCTURE和SABER更精确、更高效，而且无需分型祖先基因。

相关论文发表在爱思唯尔期刊《美国人类遗传学杂志》（The American Journal of Human Genetics）上。（科学新闻杂志 周瑞霞/编译）

（《美国人类遗传学杂志》（The American Journal of Human Genetics），Volume 82, Issue 2, 290-303，Sriram Sankararaman，Eran Halperin）

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《美国人类遗传学杂志》发表论文
http://www.ajhg.org/AJHG/fulltext/S0002-9297(08)00079-7