原位PCR和原位RT-PCR步骤范例

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1、原位PCR步骤
1）预处理：
（1）切片常规脱蜡；
（2）0.2mol/L HCl处理10min；
（3）5μg/ml蛋白酶K消化组织37℃10min；
（4）Nase消化组织37℃ 30min；
（5）梯度酒精脱水，室温干燥。

2）原位扩增：
（1）切片滴加特异性序列引物30μLPCR扩增反应液，覆盖硅化盖玻片，石蜡油封边；
（2）PCR热循环：94℃，1min；55℃，1min；72℃，1.5min，共25～30个循环，72℃延伸10min；
（3）氯仿洗去盖玻片，4％多聚甲醛后固定10min，梯度酒精脱水，干燥。

3) 原位杂交：
（1）加地高辛标记探针的杂交液，98℃变性10min，-20℃退火5min，42℃杂交过夜。
（2）杂交后用2×SSC洗涤10min，3次，1×SSC洗涤10min，3次；
（3）缓冲液洗涤10min，3次；
（4）加碱性磷酸酶标记的羊抗地高辛抗体复合物，37℃，2h；
（5）缓冲液洗涤5min，3次；
（6）NBT、BCIP暗处显色，镜下控制，终止显色。
（7）常规脱水：透明、封固。

2、原位RT-PCR步骤
1）预处理：
（1）蛋白酶K(0.3mg/mL) 54℃消化20min，蒸馏水洗；
（2）95℃加热3min，灭活残存的蛋白酶。

2）原位扩增：
（1）在有RNA酶抑制剂存在的条件下，用随机六聚物进行逆转录反应；
（2）用热启动法进行PCR扩增。标本加热至75℃时加上反应液，覆以盖玻片，四周用指甲油密封。然后将温度升至95℃，2min。再将热循环仪设定为95℃，45s，55℃，1min和75℃，45s，共26次循环；
（3）扩增结束后，在80℃烤15min～30min。

3）原位杂交：
（1）杂交前标本95℃加热3min；
（2）加上杂交液，湿盒内50℃过夜；杂交液组成：25％硫酸葡聚糖，2×SSC，50％甲酰胺，0.33mg/ml变性的鲑鱼精子DNA， 每0．5mL杂交液内含生物素标记探针1ng。
（3）扩增的β-肌动蛋白和IL-6用DAKO检测试剂盒K600(链霉卵白素，生物素标记的碱性磷酸酶和硝基四氮唑蓝)检测。阳性反应呈紫色。(http://www.ebiotrade.com/)