几个生物学数据库

几个生物学数据库


DDBJ/EMBL和GenBank的一般联系信息以及提交DNA序列到这些数据库的入口。
DDBJ（信息生物学中心，NIG）
地址：DDBJ，1111 Yata， Mishima，Shiznoka 411，Japan
传真：81-559-81-6849
E-mail
提交： ddbjsub@ddbj.nig.ac.jp
更新： ddbjupd@ddbj.nig.ac.jp
信息： ddbj@ddbj.nig.ac.jp
互联网
主页：http://www.ddbj.nig.ac.jp/
提交：http://sakura.ddbj.nig.ac.jp/
EMBL（欧洲生物信息协会，EMBL分部）
地址：EMBL Outstation, EBI, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton Cambridge, CB 10 1SD, United Kingdom
电话：01.22.349.44.44
传真：01.22.349.44.68
E-mail
提交： datasubs@ebi.ac.uk
更新： update@ebi.ac.uk
信息： datalib@ebi.ac.uk
互联网
主页：http://www.ebi.ac.uk/
提交：http://www.ebi.ac.uk/subs/allsubs.html
WebIn：http://www.ebi.ac.uk/submission/webin.html
GenBank（国家生物技术信息中心，NIH）
地址：Gen Bank National Center for Biotechnology Information, Nationtional Library of Medicine, National Institutes of Health, Building 38A, Room 8N805, Bethesda MD 20894
电话：301-496-2475
传真：301-480-9241
E-mail
提交： gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov
EST/GSS/STS batch-sub@ncbi.nlm.nih.gov
更新： update@ncbi.nlm.nih.gov
信息： datalib@ebi.ac.uk
互联网
主页：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
提交：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/GenBank/submit.html
BankIt: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/BankIt/
其它资源，按照它们在本章中出现的顺序列出如下：
分类学浏览器： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/tax.html
在DNA序列数据库中使用的遗传密码：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/htbin-post/Taxonomy/wprintgc?mode=c
寻找ORF：链接到BLAST页上的读框架寻找器
http://ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorg.html
DDBJ/EMBL/GenBank特征表文档可用WWW方式获得或者从EBI或NCBI的FTP服务器上得到PostScript文件。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/collab/FT/
http://www.ebi.ac.uk/ebi_docs/embl_db/ft/feature_table.html
ftp://ncbi.nlm.nih.gov/genbank/docs/
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/embl/doc/
EMBL和GenBank数据库的版本信息
EMBL ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/embl/release/relnotes.doc
GenBank ftp://ncbi.nlm.nih.gov/genbank/gbrel.txt
Sequin: DNA序列数据库的提交和更新工具
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin
EST, STS和GTS主页，获取信息和向这些特定GenBank数据库提交序列
EST http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST
STS http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTS
GSS http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbGSS
HTGS主页：高吞吐量基因组序列资源，工具和信息
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/HTGS