TRAF1–C5是类风湿性关节炎的风险基因位点

TRAF1–C5是类风湿性关节炎的风险基因位点
ABSTRACT
Background Rheumatoid arthritis has a complex mode of inheritance. Although HLA-DRB1 and PTPN22 are well-established susceptibility loci, other genes that confer a modest level of risk have been identified recently. We carried out a genomewide association analysis to identify additional genetic loci associated with an increased risk of rheumatoid arthritis.
类风湿性关节炎是一种复杂的遗传病。虽然HLA-DRB1和PTPN22是易感基因部位，最近也确定了其他的风险基因。我们采用染色体组关联分析确定附加遗传基因座与类风湿关节炎的风险增高有关。
Methods We genotyped 317,503 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in a combined case–control study of 1522 case subjects with rheumatoid arthritis and 1850 matched control subjects. The patients were seropositive for autoantibodies against cyclic citrullinated peptide (CCP). We obtained samples from two data sets, the North American Rheumatoid Arthritis Consortium (NARAC) and the Swedish Epidemiological Investigation of Rheumatoid Arthritis (EIRA). Results from NARAC and EIRA for 297,086 SNPs that passed quality-control filters were combined with the use of Cochran–Mantel–Haenszel stratified analysis. SNPs showing a significant association with disease (P<1x10–8) were genotyped in an independent set of case subjects with anti–CCP-positive rheumatoid arthritis (485 from NARAC and 512 from EIRA) and in control subjects (1282 from NARAC and 495 from EIRA).
我们结合1522例类风湿关节炎患者和1850配对对照受试者进行病例－对照研究，进行了317503个单链核苷酸多态性的基因分型。患者循环血液中抗瓜氨酸多肽的自身抗体(CCP)的血清学反应呈阳性。我们的抗体来自北美类风湿关节炎协会(NARAC)和瑞典类风湿关节炎的流行病学调查研究(EIRA)二部分。来自NARAC和 EIRA 的 297,086 SNPs 进行了质量控制的过滤，并用Cochran–Mantel–Haenszel层析。与对照组(来自NARAC1282名和来自EIRA 的495 名)相比，SNPs是与抗CCP阳性的类风湿关节炎的患者(来自NARAC485名和来自EIRA 的512 名)上的独立的基因位点相关的(P<1x10–8)。
Results We observed associations between disease and variants in the major-histocompatibility-complex locus, in PTPN22, and in a SNP (rs3761847) on chromosome 9 for all samples tested, the latter with an odds ratio of 1.32 (95% confidence interval, 1.23 to 1.42; P=4x10–14). The SNP is in linkage disequilibrium with two genes relevant to chronic inflammation: TRAF1 (encoding tumor necrosis factor receptor–associated factor 1) and C5 (encoding complement component 5).
我们观察了疾病和主要组织相容复合物位点突变体PTPN22和一个SNP (rs3761847)有关，所有的患者在9号染色体都有一个SNP (rs3761847)，优势比是1.32（95%可信区间，1.23－ 1.42; P=4x10–14）。这个SNP是和2个慢性炎症基因失衡有关的，即TRAF1（编码肿瘤坏死银子受体相关因子1）和 C5（编码补体成份5）
Conclusions A common genetic variant at the TRAF1–C5 locus on chromosome 9 is associated with an increased risk of anti–CCP-positive rheumatoid arthritis.
结论：常见的9号染色体TRAF1–C5位点的遗传改变与抗–CCP反应阳性的类风湿关节炎的风险增高相关。

编译：
TRAF1–C5是类风湿性关节炎的风险基因位点

类风湿性关节炎是一种复杂的遗传病。虽然HLA-DRB1和PTPN22是易感基因部位，最近也确定了其他的风险基因。研究人员采用染色体组关联分析确定附加遗传基因座与类风湿关节炎的风险增高有关。（NEJM，September 5, 2007 ）

研究人员结合1522例类风湿关节炎患者和1850配对对照受试者进行病例－对照研究，进行了317503个单链核苷酸多态性的基因分型。患者循环血液中抗瓜氨酸多肽的自身抗体(CCP)的血清学反应呈阳性。我们的抗体来自北美类风湿关节炎协会(NARAC)和瑞典类风湿关节炎的流行病学调查研究(EIRA)二部分。来自NARAC和 EIRA 的 297,086 SNPs 进行了质量控制的过滤，并用Cochran–Mantel–Haenszel层析。与对照组(来自NARAC1282名和来自EIRA 的495 名)相比，SNPs是与抗CCP阳性的类风湿关节炎的患者(来自NARAC485名和来自EIRA 的512 名)上的独立的基因位点相关的(P<1x10–8)。

我们观察了疾病和主要组织相容复合物位点突变体PTPN22和一个SNP (rs3761847)有关，所有的患者在9号染色体都有一个SNP (rs3761847)，优势比是1.32（95%可信区间，1.23－ 1.42; P=4x10–14）。这个SNP是和2个慢性炎症基因失衡有关的，即TRAF1（编码肿瘤坏死银子受体相关因子1）和 C5（编码补体成份5）。

常见的9号染色体TRAF1–C5位点的遗传改变与抗–CCP反应阳性的类风湿关节炎的风险增高相关。