直接从蛋白质结构预测蛋白质分离

懒扎衣

8月发表在PNAS的一篇文章为药物研发和蛋白质工程研究带来了新的气息。来自美国任色列理工学院（Rensselaer Polytechnic Institute，RPI）生物化学教授Curt M. Breneman和同事们通过将数学和计算机应用于药物研发过程中，可以直接从蛋白质结构预测蛋白质分离的行为。这种新的蛋白质仿真法将有助于缩短药物研发的时间，也有助于蛋白质组学、蛋白质结构和功能的研究与发展。

    这一技术是基于之前的Breneman实验室的快速预测小分子药物毒副作用的方法上发展起来的：将一定数量的某种蛋白在特定条件下绑在介质上，通过获得的吸附等温线（adsorption isotherm parameters）数据分析这一蛋白在层析柱中分离的特点和情况。

    Breneman认为，“这是一门新的技术，将实验室所获得的信息以计算机程序仿真蛋白质的行为得到预测，对于生物技术的发展有很重大的影响。”

    研究结果显示，这种仿真模拟可准确地预测蛋白质的行为，而且可以应用于生物分离工程上，比如药物研发的蛋白质纯化工艺，这样就减少了研发时间，也可迅速地了解药物的疗效和副作用。
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