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[【经验与求助】] MIP分子到位探针技术基本原理

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发表于 2007-8-4 12:18:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
探针结构如上图所示:
红色—SNP位点与基因组DNA同源的配对区域
黑色—PCR引物位置
粉色—第一次酶切裂解位点
蓝色—第二次酶切裂解位点
绿色—与芯片特异性结合的标签序列


反应步骤1:
IP探针混合物退火与基因组DNA(紫色)杂交



反应步骤2:
色序列与基因组上SNP位点的上下游序列配对杂交,使MIP探针形成一环状,并由聚合酶补平SNP位点





反应步骤3:
粉色酶解位点裂解,使MIP探针成一线性片段,此片段内已补平了SNP位点



反反应步骤4:
如上线性片段两端的引物位点进行PCR扩增,扩增过程中在靠近Tag片断端的引物序列部分标记上相应的荧光,而且在四种曾加入不同dA/dT/dC/dG的管子中分别标记上四种不同的荧光信号,以便于下一步的检测
反应步骤5:
蓝色酶解位点裂解,形成如下的带荧光标记的Tag序列混合物



反应步骤6:
并四种不同荧光标记的Tag序列混合物,与芯片杂交、洗涤、染色、扫描,获得实验结果。

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